成人二維碼車費與成人八達通相同；特惠二維碼車費則與小童八達通相同。
經尖沙咀/尖東轉車的車程，會被視作兩個獨立車程。
乘客需於每次入閘前透過MTR Mobile車票二維碼、AlipayHK易乘碼、支付寶乘車碼、雲閃付App港鐵乘車碼及微信搭車碼選定所需要購買的車票種類（成人或特惠）及等級（普通或東鐵綫頭等），入閘後將不能作出更改。一般情況下，車票種類及等級將根據上一個車程紀錄而預設，乘客請按出行需要在入閘前作出更改，以免有誤。
二維碼車費會根據已選定的車票種類及等級收費，不設退款。
如乘客在車票二維碼選擇頭等服務，但二維碼內所顯示的入閘及出閘車站均不是東鐵綫車站，仍須支付東鐵綫指定路段的八達通車費，作為頭等額外費用。
成人二維碼(12至64歲人士，包括學生）
特惠二維碼(3-11歲的小童及 65歲或以上長者）
MTR Mobile車票二維碼
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AlipayHK易乘碼 及支付寶乘車碼
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✔分為兩種特惠車票類別：小童車票（3-11歲的小童）及長者車票（65歲或以上的長者）
雲閃付App港鐵乘車碼
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微信搭車碼
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除車費扣減優惠之外 (如適用) ，其他車費優惠均不適用於二維碼乘搭港鐵。
公共交通費用補貼只適用於以AlipayHK 易乘碼 (EasyGo)或使用MTR Mobile 車票二維碼並選擇以AlipayHK 作為付款方式乘搭港鐵重鐵網絡 (機場快綫除外) 的車費。使用其他二維碼乘搭港鐵均不適用於公共交通費用補貼 (包括支付寶乘車碼、雲閃付App 港鐵乘車碼、微信搭車碼或選擇以其他付款方式連結MTR Mobile 的車票二維碼)。
詳情請按此參閱車費表。